open technica: MacにR + randomForestをインストール

Saturday, September 08, 2012

OSX 10.7にRをインストールする。今回はMacPortsを使う。

$ sudo port install R

これでRコマンド（対話型のインタープリター）がインストールされる。終了はq()関数。

$ R
> q()

対話型のインタープリターではなく、ソースをファイルから実行するにはRscriptコマンドを使う。とりあえず引数を出力するサンプルを作ってみる。

# hello.r
arg <- commandArgs(TRUE)
cat("hello", arg, "\n")

実行

$ Rscript hello.r world
hello world

PerlのCPANやRubyのRubygemsのようなパッケージ管理ツールが組み込まれていて、install.packages関数でパッケージをインストールできる（CRANというらしい）。試しに機械学習ライブラリのrandomForestをインストール。

> install.packages("randomForest")

MacPortsでインストールしていると、/opt/local/以下の書き込み権限がないという警告がでるので、今回はコンソールにいわれる通り、~/R/...にライブラリフォルダを作った。途中でTclのダイアログでダウンロード元を選ばされるので、普通に東京を選んだ。

インストールしたライブラリを使うのにはlibrary関数を使う。

> library("randomForest")
randomForest 4.6-6
Type rfNews() to see new features/changes/bug fixes.

その他、参考サイト。

Saturday, September 08, 2012